Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmg20bQ9Z104 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms