Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Nup160Q9Z0W3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nup160Q9Z0W3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Nup160Q9Z0W3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Nup160Q9Z0W3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
Nup160Q9Z0W3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Nup160Q9Z0W3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nup160Q9Z0W3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nup160Q9Z0W3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nup160Q9Z0W3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nup160Q9Z0W3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nup160Q9Z0W3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nup160Q9Z0W3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nup160Q9Z0W3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nup160Q9Z0W3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nup160Q9Z0W3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nup160Q9Z0W3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nup160Q9Z0W3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms