Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xpr1Q9Z0U0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xpr1Q9Z0U0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xpr1Q9Z0U0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xpr1Q9Z0U0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xpr1Q9Z0U0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xpr1Q9Z0U0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xpr1Q9Z0U0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xpr1Q9Z0U0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Xpr1Q9Z0U0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Xpr1Q9Z0U0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Xpr1Q9Z0U0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Xpr1Q9Z0U0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms