Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnip1Q9WUU8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnip1Q9WUU8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms