Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn5Q9WU28 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn5Q9WU28 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn5Q9WU28 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn5Q9WU28 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn5Q9WU28 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn5Q9WU28 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn5Q9WU28 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn5Q9WU28 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn5Q9WU28 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn5Q9WU28 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn5Q9WU28 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn5Q9WU28 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn5Q9WU28 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn5Q9WU28 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn5Q9WU28 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pfdn5Q9WU28 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn5Q9WU28 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms