Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema6cQ9WTM3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sema6cQ9WTM3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms