Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trpc2Q9R244 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc2Q9R244 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms