Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abcc6Q9R1S7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc6Q9R1S7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc6Q9R1S7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms