Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psma4Q9R1P0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma4Q9R1P0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms