Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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SrpxQ9R0M3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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SrpxQ9R0M3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpxQ9R0M3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpxQ9R0M3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpxQ9R0M3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpxQ9R0M3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpxQ9R0M3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpxQ9R0M3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpxQ9R0M3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpxQ9R0M3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpxQ9R0M3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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