Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkab1Q9R078 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prkab1Q9R078 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkab1Q9R078 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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