Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AmfrQ9R049 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AmfrQ9R049 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AmfrQ9R049 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AmfrQ9R049 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AmfrQ9R049 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AmfrQ9R049 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AmfrQ9R049 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms