Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Npas3Q9QZQ0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Npas3Q9QZQ0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Npas3Q9QZQ0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms