Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ripk3Q9QZL0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ripk3Q9QZL0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ripk3Q9QZL0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ripk3Q9QZL0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ripk3Q9QZL0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ripk3Q9QZL0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ripk3Q9QZL0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ripk3Q9QZL0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ripk3Q9QZL0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ripk3Q9QZL0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ripk3Q9QZL0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms