Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copg1Q9QZE5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms