Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndrg3Q9QYF9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ndrg3Q9QYF9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms