Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bcl11aQ9QYE3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bcl11aQ9QYE3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcl11aQ9QYE3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bcl11aQ9QYE3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms