Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphp1Q9QY53 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphp1Q9QY53 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms