Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY9

Pex3, Peroxisomal biogenesis factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex3Q9QXY9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pex3Q9QXY9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pex3Q9QXY9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms