Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ChmQ9QXG2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChmQ9QXG2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms