Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tcea2Q9QVN7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tcea2Q9QVN7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms