Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma6Q9QUM9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms