Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PolkQ9QUG2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PolkQ9QUG2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PolkQ9QUG2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PolkQ9QUG2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms