Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrfQ9JM73 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms