Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Higd1aQ9JLR9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1aQ9JLR9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms