Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp4Q9JKV5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms