Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod2Q9JKK7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod2Q9JKK7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
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