Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trem1Q9JKE2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms