Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ap3m1Q9JKC8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms