Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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