Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Tuba8Q9JJZ2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tuba8Q9JJZ2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms