Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfhx4Q9JJN2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfhx4Q9JJN2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfhx4Q9JJN2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfhx4Q9JJN2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfhx4Q9JJN2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfhx4Q9JJN2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfhx4Q9JJN2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfhx4Q9JJN2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfhx4Q9JJN2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfhx4Q9JJN2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfhx4Q9JJN2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfhx4Q9JJN2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms