Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc22Q9JIG7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc22Q9JIG7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc22Q9JIG7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc22Q9JIG7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc22Q9JIG7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc22Q9JIG7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc22Q9JIG7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc22Q9JIG7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc22Q9JIG7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc22Q9JIG7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc22Q9JIG7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms