Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET54

Palld, Palladin, mousemouse

Predictions only

Length 1,408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PalldQ9ET54 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PalldQ9ET54 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PalldQ9ET54 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms