Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ush1cQ9ES64 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ush1cQ9ES64 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms