Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chrnb2Q9ERK7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrnb2Q9ERK7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrnb2Q9ERK7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrnb2Q9ERK7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrnb2Q9ERK7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrnb2Q9ERK7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrnb2Q9ERK7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrnb2Q9ERK7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrnb2Q9ERK7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrnb2Q9ERK7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrnb2Q9ERK7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrnb2Q9ERK7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrnb2Q9ERK7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 528.5 ms