Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slco1c1Q9ERB5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slco1c1Q9ERB5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms