Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ52

Vmn1r48, Vomeronasal type-1 receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r48Q9EQ52 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r48Q9EQ52 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms