Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcr6Q9EQ16 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms