Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ropn1lQ9EQ00 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ropn1lQ9EQ00 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms