Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms