Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp1bQ9EPL6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp1bQ9EPL6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms