Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Eif3fQ9DCH4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3fQ9DCH4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms