Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pop7Q9DCH2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pop7Q9DCH2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms