Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf6Q9DBU5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms