Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms