Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms