Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim23Q9DAL0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim23Q9DAL0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim23Q9DAL0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim23Q9DAL0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim23Q9DAL0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim23Q9DAL0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim23Q9DAL0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim23Q9DAL0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim23Q9DAL0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim23Q9DAL0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim23Q9DAL0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim23Q9DAL0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim23Q9DAL0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim23Q9DAL0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim23Q9DAL0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim23Q9DAL0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim23Q9DAL0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim23Q9DAL0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim23Q9DAL0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim23Q9DAL0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim23Q9DAL0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim23Q9DAL0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms