Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700018B08RikQ9DA83 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700018B08RikQ9DA83 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700018B08RikQ9DA83 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700018B08RikQ9DA83 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700018B08RikQ9DA83 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700018B08RikQ9DA83 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700018B08RikQ9DA83 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700018B08RikQ9DA83 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700018B08RikQ9DA83 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700018B08RikQ9DA83 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700018B08RikQ9DA83 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700018B08RikQ9DA83 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700018B08RikQ9DA83 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms