Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tmem239Q9DA47 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tmem239Q9DA47 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tmem239Q9DA47 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tmem239Q9DA47 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tmem239Q9DA47 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Tmem239Q9DA47 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Tmem239Q9DA47 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Tmem239Q9DA47 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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